Es el Fondo Especial para el Financiamiento de la Educación Superior Estatal, que el gobierno debe proporcionar a las cuatro universidades públicas (UCR, ITCR, UNA y UNED) según lo establece el artículo 85 de la Constitución Política.
Cada cinco años, las Universidades Públicas hacen un plan donde especifican cuánto dinero invertirán durante el siguiente quinquenio y se lo presentan al gobierno.
El plan es discutido por una Comisión de Enlace, conformada por los rectores o rectoras de las cuatro universidades públicas y los ministros o ministras de Educación, Hacienda, Planificación y Ciencia y Tecnología.
Una vez que se aprueba el FEES en la Comisión de Enlace, pasa a la Presidencia de la República y a la Asamblea Legislativa para ser incluido en el presupuesto ordinario del Estado.
Las cifras acordadas se incluyen en el periodo fiscal de cada año y los dineros se giran anualmente a cada una de las instituciones.
Si el FEES no se acuerda en el tiempo necesario, las universidades pueden presentarlo directamente a la Presidenta de la República y ella lo pasaría a la Asamblea Legislativa. En última instancia, la Asamblea es la que resuelve, pues es la que aprueba el presupuesto.